More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1317 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  100 
 
 		 443 aa  850    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  51.84 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  45.02 
 
 		 445 aa  348  8e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  44.77 
 
 		 442 aa  342  9e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  45.92 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  45.54 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  43.16 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  36.63 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  34.11 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  34.42 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  34.43 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  33.72 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  34.58 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 455 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 455 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  34.37 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  34.37 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  32.36 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  36.01 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  32.71 
 
 		 455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  32.78 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  33.41 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 454 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 516 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 505 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 520 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  27.8 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 517 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 554 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 515 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 503 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 505 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 465 aa  116  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  29.61 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 531 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 521 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  21.76 
 
 		 462 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  29.09 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  30.95 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 481 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  30.68 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 445 aa  106  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.37 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.99 
 
 		 479 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 499 aa  103  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.86 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.75 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.62 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 505 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 485 aa  97.4  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  24.43 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 525 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 518 aa  93.6  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>