More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2591 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  88.52 
 
 		 479 aa  776    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 493 aa  937    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  98.38 
 
 		 493 aa  924    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  64.98 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  62.69 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  61.47 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  51.35 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  48.48 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.44 
 
 		 483 aa  339  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  45.16 
 
 		 520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  43.48 
 
 		 520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  42.92 
 
 		 517 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  44.83 
 
 		 515 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  44.83 
 
 		 515 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  44.37 
 
 		 501 aa  332  8e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  44.83 
 
 		 515 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  44.83 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  41.39 
 
 		 509 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  42.38 
 
 		 505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  41.94 
 
 		 503 aa  328  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  41.85 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  47.64 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  43.71 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  44.6 
 
 		 516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  43.68 
 
 		 531 aa  309  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  42.02 
 
 		 505 aa  309  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  42.89 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  41.28 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  42.36 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  36.16 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  40 
 
 		 486 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  41.36 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  36.51 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  36.79 
 
 		 453 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  36.17 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  33.18 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 462 aa  133  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  26.44 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.13 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.41 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25 
 
 		 451 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 478 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  26.21 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 466 aa  97.8  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 443 aa  97.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.47 
 
 		 462 aa  93.6  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  21.74 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  23.9 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.71 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  22.67 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  26.67 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  22.38 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.91 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.62 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.49 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>