243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3037 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  86.31 
 
 		 453 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  878    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  45.64 
 
 		 446 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  43.51 
 
 		 458 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  36.99 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  35.44 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  34.45 
 
 		 483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  36.17 
 
 		 493 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  34.48 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  34.81 
 
 		 481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 509 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.17 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  37.91 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 516 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 520 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  31 
 
 		 505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 520 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 501 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 515 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 515 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 515 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  29.53 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  31.04 
 
 		 495 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  33.1 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  37.71 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  31 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  21.01 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  21.33 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  22.65 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  20.36 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  21.48 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  22.22 
 
 		 456 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  22.07 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.9 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.05 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  22.71 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  24.91 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  24.91 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  21.23 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  26 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  21.64 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  24.31 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  21.29 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  27.2 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  25.75 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.64 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  24.29 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  25.89 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>