More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3583 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3583  MATE efflux family protein  100 
 
 		 438 aa  832    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.662735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0953  MATE efflux family protein  59.49 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  38.76 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 466 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 462 aa  182  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  30.66 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  28.44 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  28.9 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  26.98 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  28.31 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  28.31 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  28.31 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  28.51 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  28.8 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  29 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  27.64 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  31.31 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  29.36 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  30.39 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  29.36 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  29.91 
 
 		 470 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  28.79 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  26.04 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  28.31 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  29.38 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  30.48 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  29.38 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 453 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  26.92 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  27.94 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  28.54 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  27.66 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  28.15 
 
 		 457 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 457 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  28.15 
 
 		 457 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 457 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  28.15 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  28.57 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  28.82 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  28.57 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  29 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  29 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  29.11 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  27.42 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  29.74 
 
 		 460 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 460 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 474 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 453 aa  126  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  29.61 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  28.13 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  28.03 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0948  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 464 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  26.88 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  26.88 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1006  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 469 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  30.09 
 
 		 451 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  26.88 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  26.88 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  26.88 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 452 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>