More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1497 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  100 
 
 
460 aa  919    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  40.99 
 
 
447 aa  353  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  39.86 
 
 
459 aa  351  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  42.21 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  40.52 
 
 
451 aa  309  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  40.52 
 
 
451 aa  309  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  36.01 
 
 
485 aa  297  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  35.73 
 
 
462 aa  280  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  33.49 
 
 
440 aa  236  9e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  32.14 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.75 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
447 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.41 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
452 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.97 
 
 
439 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
449 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
455 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.52 
 
 
477 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
460 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
454 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.53 
 
 
464 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
452 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  31.49 
 
 
437 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.67 
 
 
455 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
455 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  31.26 
 
 
460 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.85 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.44 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  31.25 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.19 
 
 
452 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
455 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.08 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
454 aa  145  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28 
 
 
461 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
468 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
461 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.34 
 
 
460 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
456 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.56 
 
 
451 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
455 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.14 
 
 
455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  30.54 
 
 
457 aa  136  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.92 
 
 
460 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
454 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25 
 
 
464 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.2 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.75 
 
 
454 aa  131  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  28.41 
 
 
478 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
453 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.74 
 
 
496 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.08 
 
 
451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.67 
 
 
496 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.56 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
455 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  24.28 
 
 
459 aa  126  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
454 aa  126  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.07 
 
 
455 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
451 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  29.81 
 
 
458 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
445 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.34 
 
 
448 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.4 
 
 
448 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
451 aa  120  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
461 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
486 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  23.19 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  25.47 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  25.42 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.15 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.99 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  25.42 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  23.19 
 
 
451 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.61 
 
 
452 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  23.43 
 
 
451 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  23.19 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.73 
 
 
490 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
461 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.61 
 
 
452 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.76 
 
 
451 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.52 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>