More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02200 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 466 aa  917    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  67.17 
 
 		 466 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  54.07 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  41 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  36.4 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  36.78 
 
 		 449 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  36.09 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 455 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  36.01 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  32.53 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  31.37 
 
 		 455 aa  231  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.2 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.89 
 
 		 454 aa  206  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.6 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 466 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  31.5 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 455 aa  193  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  29.74 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.91 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.22 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  32.84 
 
 		 470 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.51 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.31 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.27 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  29.5 
 
 		 467 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.96 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.98 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.91 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.41 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.64 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  26.07 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.43 
 
 		 448 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  27 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  26.78 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  26.34 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.63 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.28 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.61 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.61 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.11 
 
 		 451 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.87 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.54 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.54 
 
 		 450 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  25.39 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 461 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  23.09 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  25.93 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.17 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  25.86 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  24.63 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.38 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>