49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3661 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  49.24 
 
 		 478 aa  201  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  42.08 
 
 		 485 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  40.21 
 
 		 467 aa  154  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  39.5 
 
 		 454 aa  147  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  38.54 
 
 		 473 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  38.19 
 
 		 460 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  38.19 
 
 		 457 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  37.82 
 
 		 455 aa  141  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 460 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  36.68 
 
 		 460 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  35.18 
 
 		 437 aa  134  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  35.18 
 
 		 437 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.88 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  39.67 
 
 		 470 aa  131  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  33.67 
 
 		 458 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 454 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.1 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 460 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 466 aa  54.7  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 484 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 451 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.15 
 
 		 485 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.12 
 
 		 451 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 445 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 499 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 457 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.22 
 
 		 463 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 458 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21.65 
 
 		 475 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 477 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 442 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 538 aa  45.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 445 aa  45.1  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 469 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 554 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  21.84 
 
 		 464 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  21.84 
 
 		 464 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  24.18 
 
 		 428 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 454 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  19.69 
 
 		 455 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 461 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 470 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  23 
 
 		 446 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 468 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 455 aa  41.6  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.33 
 
 		 496 aa  41.6  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>