More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5639 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  100 
 
 
450 aa  890    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  50.67 
 
 
451 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  50.67 
 
 
451 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  42.38 
 
 
460 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  37.27 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  37.97 
 
 
459 aa  309  8e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  34.14 
 
 
462 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  34 
 
 
485 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  32.52 
 
 
454 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
440 aa  219  7e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
455 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
447 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
447 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
449 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  29.6 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.27 
 
 
464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.95 
 
 
477 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
460 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
461 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
456 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
452 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.33 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
455 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.72 
 
 
455 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.93 
 
 
449 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 
452 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.21 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.49 
 
 
455 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
455 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
447 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.9 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.11 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.72 
 
 
464 aa  134  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.16 
 
 
455 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
466 aa  133  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.25 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  24.88 
 
 
452 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.21 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.01 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  23.78 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  23.78 
 
 
451 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  23.78 
 
 
451 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  23.78 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  23.54 
 
 
451 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
453 aa  127  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.33 
 
 
496 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
460 aa  127  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
456 aa  127  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
452 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.93 
 
 
485 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
460 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.54 
 
 
451 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  23.31 
 
 
451 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.54 
 
 
451 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.06 
 
 
461 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
458 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.31 
 
 
452 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
458 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.58 
 
 
478 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  24.87 
 
 
454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  24.52 
 
 
446 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.15 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.57 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  22.49 
 
 
496 aa  120  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  26.19 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.15 
 
 
462 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
447 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  23.87 
 
 
460 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
454 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.39 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  24.26 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
868 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  24.32 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.54 
 
 
462 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  24.55 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  24.33 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>