More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2445 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  74.66 
 
 		 448 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  73.91 
 
 		 449 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  75.11 
 
 		 450 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  74.04 
 
 		 451 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  75.34 
 
 		 450 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  74.04 
 
 		 451 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  74.89 
 
 		 450 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 443 aa  882    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  74.04 
 
 		 451 aa  666    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  74.04 
 
 		 451 aa  666    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  70 
 
 		 448 aa  634  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  68.41 
 
 		 449 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  66.9 
 
 		 458 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  67.82 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  36.83 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  34.49 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  33.25 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  34.57 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  35.96 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  35.66 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.67 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 448 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  30.14 
 
 		 464 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.38 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  31.71 
 
 		 459 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  31.87 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.9 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 447 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.68 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.01 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.79 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 459 aa  182  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.59 
 
 		 456 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 466 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.18 
 
 		 472 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  27.74 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 440 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.68 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 461 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.88 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.11 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.11 
 
 		 447 aa  146  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  30.09 
 
 		 461 aa  146  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  27.62 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  27.03 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.63 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.83 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.91 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 541 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.52 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  25.82 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.52 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  25.78 
 
 		 546 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.32 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.81 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>