More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1477 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  100 
 
 
462 aa  915    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0975  multi antimicrobial extrusion protein MatE  44.05 
 
 
454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1128  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.83 
 
 
455 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.21564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2155  multi anti extrusion protein MatE  47.41 
 
 
460 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185662  normal  0.158965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0678  multi anti extrusion protein MatE  33.87 
 
 
463 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.026255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  31.31 
 
 
541 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  31.8 
 
 
546 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.31 
 
 
541 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
447 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.58 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.35 
 
 
447 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.94 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  26.58 
 
 
447 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.48 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  27.55 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
461 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
452 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  22.93 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.89 
 
 
456 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.47 
 
 
467 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.79 
 
 
466 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  24.75 
 
 
454 aa  114  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
445 aa  113  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.4 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
451 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.16 
 
 
496 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
450 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
451 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  25.12 
 
 
452 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.09 
 
 
462 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
454 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.59 
 
 
455 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.19 
 
 
439 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.19 
 
 
452 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.89 
 
 
454 aa  106  8e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  25.28 
 
 
455 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
447 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
448 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
458 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
458 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
468 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
454 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  23.79 
 
 
445 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
442 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  25.81 
 
 
448 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.46 
 
 
460 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.71 
 
 
460 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  24.18 
 
 
455 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.52 
 
 
443 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
456 aa  99  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.14 
 
 
451 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  25.16 
 
 
449 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
467 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  22.71 
 
 
451 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  25.9 
 
 
449 aa  96.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.39 
 
 
456 aa  96.7  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
500 aa  96.7  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  24.34 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  22.67 
 
 
451 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  24.34 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  26.15 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.75 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.36 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  25 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  22.67 
 
 
451 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.75 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.75 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.46 
 
 
467 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.65 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  24.84 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.75 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.75 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
455 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  24.11 
 
 
448 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  22.67 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  22.67 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  22.67 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  24.66 
 
 
450 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  22.91 
 
 
459 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  22.1 
 
 
451 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
454 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
456 aa  94  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.34 
 
 
451 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  24.01 
 
 
451 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
462 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
459 aa  93.6  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.18 
 
 
454 aa  93.6  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  22.49 
 
 
451 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
453 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  24.4 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>