More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0975 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1128  multi antimicrobial extrusion protein MatE  90.51 
 
 		 455 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0975  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 454 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  44.05 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2155  multi anti extrusion protein MatE  45.69 
 
 		 460 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185662  normal  0.158965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0678  multi anti extrusion protein MatE  36.88 
 
 		 463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.026255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  30.24 
 
 		 546 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.44 
 
 		 541 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  28.12 
 
 		 541 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.03 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  25.94 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  25.12 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 451 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.66 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  24.63 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  29.97 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 460 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 452 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 451 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25.97 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  24.12 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  22.73 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  24.71 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 451 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 		 449 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 454 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.82 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.78 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.18 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  24.66 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.66 
 
 		 451 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 442 aa  94.4  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  25.6 
 
 		 450 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  25.87 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  25.6 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  22.96 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  25.36 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 451 aa  90.1  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.01 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  24.94 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  24.94 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  21.95 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  24.88 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  25.36 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  22.97 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.12 
 
 		 451 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 455 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  23.89 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  23.81 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  24.94 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  20.82 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  23 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.97 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.65 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.76 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  22.57 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  24.09 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  21.6 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>