More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1128 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1128  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 455 aa  891    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0975  multi antimicrobial extrusion protein MatE  91.83 
 
 		 454 aa  789    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  43.83 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2155  multi anti extrusion protein MatE  47.09 
 
 		 460 aa  319  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185662  normal  0.158965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0678  multi anti extrusion protein MatE  36.87 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.026255  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  30.13 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.33 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  28.8 
 
 		 541 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.13 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  23.8 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 455 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  24.65 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  24.38 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  26.16 
 
 		 449 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 452 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.63 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.63 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  23.06 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.15 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 448 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  24.33 
 
 		 496 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 455 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  25.47 
 
 		 448 aa  96.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  24.6 
 
 		 442 aa  96.7  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  23.29 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  23.29 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.08 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.04 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.67 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  21.96 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.67 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.6 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.13 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  23.33 
 
 		 465 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  23.09 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 447 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.22 
 
 		 452 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  23.52 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  25.18 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 472 aa  87.4  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  25.25 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  21.05 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  23.85 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  23.27 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25.18 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  21.33 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.53 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>