More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0678 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0678  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 463 aa  886    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.026255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2155  multi anti extrusion protein MatE  43.19 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185662  normal  0.158965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0975  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.88 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  33.87 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1128  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.87 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  30.51 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  30.04 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  29.4 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.78 
 
 		 541 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.26 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 447 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.83 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.04 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.38 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.68 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.68 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.46 
 
 		 451 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.46 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.28 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.82 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  30.97 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.83 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  33.89 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.5 
 
 		 448 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 447 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.19 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.86 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 455 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 444 aa  97.8  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 462 aa  97.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 466 aa  96.7  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  23.63 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.06 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 454 aa  93.6  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.26 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  23.86 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 525 aa  93.2  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  23.86 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  23.86 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  23.86 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.51 
 
 		 448 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.88 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  26.76 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 453 aa  90.1  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  26.62 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25.17 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.3 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  23.74 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  28.48 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  21.16 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 486 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>