More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2309 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  97.78 
 
 		 541 aa  1010    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 541 aa  1080    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  96.12 
 
 		 546 aa  986    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 455 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 447 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  24.9 
 
 		 496 aa  140  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 456 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0678  multi anti extrusion protein MatE  29.16 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.026255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0975  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.12 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 448 aa  134  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.24 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.74 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 458 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 459 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.02 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.01 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.11 
 
 		 449 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 448 aa  127  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1128  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.27 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.12 
 
 		 448 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 442 aa  123  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.89 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.65 
 
 		 450 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.01 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 455 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.36 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.36 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 460 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.76 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.76 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 445 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 451 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25 
 
 		 456 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  25.94 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.62 
 
 		 446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  26 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.83 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  22.95 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  22.11 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  22.74 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  24.75 
 
 		 466 aa  113  8.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  26.33 
 
 		 448 aa  113  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  24.32 
 
 		 452 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  22.32 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  24.68 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 453 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 447 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.53 
 
 		 472 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  24.36 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  23.66 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 486 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 460 aa  107  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2155  multi anti extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185662  normal  0.158965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.87 
 
 		 454 aa  101  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  22.41 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  22.72 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>