More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002616 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  86.1 
 
 		 448 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 		 448 aa  896    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  66.59 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  47.76 
 
 		 464 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  45.68 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  44.72 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  42.4 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  34.55 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  33.18 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  33.18 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  33.95 
 
 		 443 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  34.6 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  34.3 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  34.3 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  34.22 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.18 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 458 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  34.06 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  33.64 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  33.89 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  32.46 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  32.73 
 
 		 448 aa  243  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  33.33 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  32.95 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 442 aa  230  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.56 
 
 		 455 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.56 
 
 		 455 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 451 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  33.26 
 
 		 451 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  33.02 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  33.02 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 447 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 454 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.73 
 
 		 455 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.83 
 
 		 456 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 477 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.04 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.43 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 460 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  27.09 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 447 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.86 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.69 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.12 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.72 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 493 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 466 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.78 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.67 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.91 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.74 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.07 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  24.03 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 466 aa  141  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.9 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.72 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  24.83 
 
 		 442 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>