More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 435 aa  864    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  38.48 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  34.28 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  31.44 
 
 		 440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 442 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.93 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  28.64 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.33 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.39 
 
 		 496 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  30.66 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 448 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.88 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.08 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.18 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.95 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.55 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.7 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.9 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.9 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.34 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.66 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.5 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  26.94 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.66 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.32 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.36 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.36 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.71 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  25.97 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.09 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.37 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  24.37 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.06 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  22.74 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.2 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  26.91 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.24 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  29.4 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.35 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.21 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  28.97 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  28.07 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  25.65 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.24 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  31.13 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.05 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.61 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  30.35 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  27.04 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>