More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 
461 aa  914    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  51.82 
 
 
446 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  29.06 
 
 
445 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
450 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  29.57 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  29.57 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
448 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.1 
 
 
451 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  29.1 
 
 
451 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  25.84 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
459 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.54 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  30.02 
 
 
443 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  30.43 
 
 
448 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
442 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  30.84 
 
 
450 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  30.19 
 
 
450 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
440 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.95 
 
 
450 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  29.1 
 
 
449 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.76 
 
 
448 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  28.33 
 
 
444 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  30.68 
 
 
449 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
458 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.7 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  23.99 
 
 
440 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.75 
 
 
455 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.99 
 
 
455 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
449 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  23.67 
 
 
451 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  25.94 
 
 
451 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.94 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.62 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  26.62 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  26.62 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.42 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.56 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26.18 
 
 
451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  25.71 
 
 
451 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.39 
 
 
496 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
477 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  25.71 
 
 
452 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  29.43 
 
 
456 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.73 
 
 
434 aa  136  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.43 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.12 
 
 
446 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  26.19 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  25.77 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
442 aa  131  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  26.93 
 
 
447 aa  130  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
461 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
448 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  26.46 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
460 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
451 aa  124  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  23.98 
 
 
461 aa  123  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.68 
 
 
467 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  26.42 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.94 
 
 
437 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.03 
 
 
448 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.12 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.35 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  24.59 
 
 
464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  24.18 
 
 
490 aa  120  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  29 
 
 
447 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.34 
 
 
452 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  23.81 
 
 
465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
452 aa  117  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  26.73 
 
 
456 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  25.67 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  22.7 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  25.38 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  26.01 
 
 
435 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.84 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  22.95 
 
 
472 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  24.88 
 
 
496 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  25.95 
 
 
468 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  24.29 
 
 
440 aa  107  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  23.99 
 
 
442 aa  107  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  22.69 
 
 
456 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  27.21 
 
 
454 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
437 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.7 
 
 
451 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.45 
 
 
437 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
458 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.6 
 
 
462 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  22.33 
 
 
452 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  22.22 
 
 
455 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>