293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2061 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2061  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  100 
 
 		 560 aa  1117    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.488699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 445 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 450 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.73 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 451 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.03 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 451 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 455 aa  108  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  22.9 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  22.9 
 
 		 451 aa  107  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.38 
 
 		 467 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  23.16 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.55 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  26.77 
 
 		 439 aa  104  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.37 
 
 		 496 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  24.69 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  23.8 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 440 aa  97.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 447 aa  97.1  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 466 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 449 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  22.93 
 
 		 448 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.28 
 
 		 434 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 454 aa  93.2  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 458 aa  92  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 449 aa  90.9  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.64 
 
 		 485 aa  90.9  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  25.19 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.08 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  22.62 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  23.76 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.15 
 
 		 448 aa  87.4  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 447 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 440 aa  87  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  24.04 
 
 		 439 aa  86.7  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  22.75 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.8 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  26.73 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  25.54 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.08 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.84 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.08 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  22.33 
 
 		 446 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.93 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 464 aa  80.1  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.91 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.91 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  22.77 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  23.92 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.64 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.76 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  23.67 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  23.06 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.15 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.09 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  24.85 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>