More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1344 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1344  MATE efflux family protein  100 
 
 		 470 aa  860    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0877237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  35.98 
 
 		 868 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  37.77 
 
 		 489 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  31.82 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 477 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.18 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.64 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  26.73 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 473 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 460 aa  107  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.29 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.8 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  34.34 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.88 
 
 		 454 aa  100  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.76 
 
 		 467 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.27 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 455 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 484 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  26.54 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 466 aa  94  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 460 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  21.67 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  22.14 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  21.97 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  21.63 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 452 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 437 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  21.94 
 
 		 451 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  23.36 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  24.81 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  23.36 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 442 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  23.82 
 
 		 541 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  30.17 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  20.76 
 
 		 455 aa  86.7  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  24.68 
 
 		 478 aa  86.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 460 aa  86.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 452 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>