71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2014 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2014  O-antigen and teichoic acid-like export protein  100 
 
 		 439 aa  843    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601988  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  68.96 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 463 aa  89.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  22.74 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  31.21 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  30.7 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  31.29 
 
 		 477 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 526 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 529 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.11 
 
 		 517 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  25.42 
 
 		 485 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 		 487 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 546 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  29.13 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 		 494 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  25.1 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  21.78 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.26 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  26.57 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.88 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  27.22 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 476 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 458 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  35.42 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 418 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>