121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3528 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 481 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  32.07 
 
 		 489 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 486 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  28.78 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 509 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  26.08 
 
 		 483 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 484 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 484 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  19.57 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.6 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  25.97 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.72 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.42 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.42 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.42 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.17 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.17 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.17 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  31.05 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.57 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.57 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  26.3 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.79 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.17 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.17 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.79 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.2 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.51 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.37 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.18 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.48 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  24.83 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.8 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  23.98 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 508 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.79 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  23.54 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 500 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 487 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 424 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>