45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2664 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  949    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  30.81 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  25.12 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  22.87 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.82 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  23.36 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.77 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.86 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  20.14 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.92 
 
 		 490 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 		 482 aa  53.9  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  22.75 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 487 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  30.53 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  19.81 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.33 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 463 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  28.49 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>