75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0772 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 488 aa  963    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 474 aa  123  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  27.18 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  25.3 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.58 
 
 		 430 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 489 aa  98.6  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 512 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  25.88 
 
 		 466 aa  97.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 483 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 483 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.14 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 497 aa  87.4  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  23.42 
 
 		 464 aa  87  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  26.15 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  24.42 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  27.1 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  23.41 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  20.18 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  27.03 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  20.1 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 538 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 		 476 aa  50.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.23 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  23.85 
 
 		 506 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  22.6 
 
 		 506 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 526 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1777  hypothetical protein  23.27 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00741649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  23.94 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  23.94 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  23.94 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 		 511 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 529 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>