63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0605 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
474 aa  947    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  38.29 
 
 
501 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  35.52 
 
 
538 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  38.96 
 
 
497 aa  269  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  36.69 
 
 
504 aa  262  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  36.04 
 
 
504 aa  256  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  36.53 
 
 
507 aa  253  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  34.33 
 
 
504 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 
511 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  32.38 
 
 
496 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 
499 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  32.26 
 
 
506 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  33.1 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  32.47 
 
 
461 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  29.18 
 
 
500 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 
512 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 
472 aa  169  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.48 
 
 
493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  28.68 
 
 
511 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  27.16 
 
 
493 aa  151  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 
488 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.14 
 
 
518 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.7 
 
 
488 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 
493 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 
490 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  23.02 
 
 
488 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
475 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  26.72 
 
 
430 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 
483 aa  94.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
483 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
483 aa  90.1  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.96 
 
 
464 aa  83.2  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
418 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 
500 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
491 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 
477 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
487 aa  60.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  20.69 
 
 
489 aa  58.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 
499 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.34 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
489 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  21.89 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 
446 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
436 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 
490 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 
487 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
509 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
444 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
444 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>