76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0474 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  100 
 
 		 488 aa  930    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.88 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.45 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.11 
 
 		 518 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  25.52 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 491 aa  96.7  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 493 aa  94  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  21.06 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  20.8 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  26.04 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  24.71 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  20.13 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  28.5 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  19.42 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  18.67 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  21.5 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.2 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  20.69 
 
 		 512 aa  67  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  21.72 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  17.5 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.08 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  20.71 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  18.78 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  41.43 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1777  hypothetical protein  27.42 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00741649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  20.21 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.27 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  19.36 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  23.86 
 
 		 469 aa  43.9  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 546 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  23.7 
 
 		 508 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  19.61 
 
 		 490 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>