62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3842 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 499 aa  1002    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  41.51 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  40.25 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  40.28 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  38.61 
 
 		 506 aa  333  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  38.28 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  36.96 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  33.47 
 
 		 500 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 493 aa  259  8e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  32.59 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  33.2 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  30.09 
 
 		 474 aa  200  6e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 538 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 501 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 504 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 504 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 504 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 511 aa  123  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  20.52 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  21.19 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  20.97 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  26.96 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.22 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  19.83 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  20.69 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  20.74 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 500 aa  53.5  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  31.91 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.35 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  19.62 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 500 aa  47.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  28 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  20.47 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 418 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 449 aa  43.5  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>