44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0440 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 501 aa  999    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  73.44 
 
 		 497 aa  714    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  66.81 
 
 		 504 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  66.13 
 
 		 504 aa  618  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  68.53 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  62.1 
 
 		 507 aa  597  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  67.19 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  38.07 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 538 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  28.81 
 
 		 506 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 		 500 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  29.87 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  29.59 
 
 		 496 aa  157  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  27.63 
 
 		 493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  24.43 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.18 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  22.05 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.14 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.09 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  21.12 
 
 		 466 aa  51.6  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  21.03 
 
 		 469 aa  47  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 489 aa  47  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 491 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>