40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0438 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  69.46 
 
 		 504 aa  662    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  69.29 
 
 		 507 aa  674    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  74.23 
 
 		 511 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  66.13 
 
 		 501 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 504 aa  993    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  68.38 
 
 		 504 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  65.21 
 
 		 497 aa  620  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  36.01 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  36.44 
 
 		 538 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.51 
 
 		 493 aa  163  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  27.88 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  29.22 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  29.98 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 461 aa  136  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  24.4 
 
 		 464 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  25.19 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 488 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 496 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.54 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  24.04 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.26 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  21.23 
 
 		 488 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 		 1055 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  21.28 
 
 		 466 aa  43.5  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>