70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3254 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 482 aa  949    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.51 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 475 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 496 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.31 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  25.11 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.2 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  24.56 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  21.85 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  20.31 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  21.27 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.11 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 504 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  24.23 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  20.56 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.41 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  20.49 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  24.14 
 
 		 461 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 499 aa  57  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.87 
 
 		 466 aa  57  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.15 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 478 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1251  polysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 512 aa  47  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0936834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  19.38 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  18.93 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  19.55 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 487 aa  43.1  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>