22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003537 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 476 aa  958    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02224  hypothetical protein  68.28 
 
 		 473 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.09 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  20.97 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  20.51 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  21.78 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.45 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  19.61 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 496 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  19.09 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  20.29 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>