49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0417 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 512 aa  1032    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  39.96 
 
 		 496 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  39.91 
 
 		 464 aa  316  7e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  36.92 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  38.59 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  36.11 
 
 		 461 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  37.33 
 
 		 472 aa  263  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  36.26 
 
 		 493 aa  263  8e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  35.83 
 
 		 493 aa  256  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  33.97 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 538 aa  170  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 507 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 511 aa  149  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 475 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.41 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  20.75 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  20.31 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  21.35 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.64 
 
 		 518 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  20.77 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  20.28 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 484 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  18.93 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 444 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>