87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1525 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 475 aa  933    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  50.11 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  51.37 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  42.54 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  31.74 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  32.54 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.75 
 
 		 488 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2076  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  24.28 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2088  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  26.62 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  25.34 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0676  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  26.71 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5329  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  28.77 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  22.2 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4624  hypothetical protein  23.65 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  31.37 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5253  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.57 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4786  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.14 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  20.48 
 
 		 499 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  20.89 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  26.99 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4652  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  28.47 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541983  normal  0.0587271 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  22.6 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  29.56 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  32.54 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1766  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  27.64 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.239762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  29.15 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.86 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  34.41 
 
 		 512 aa  50.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  19.86 
 
 		 483 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 449 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  20.64 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.47 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 504 aa  47  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 504 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  20.32 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  27.18 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.61 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 526 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  21.61 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  44.26 
 
 		 546 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 433 aa  43.9  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  43.5  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>