15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2653 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 480 aa  953    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  22.29 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.03 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5329  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  27.97 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>