50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1538 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
480 aa  921    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  41.44 
 
 
483 aa  282  9e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 
475 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  30.49 
 
 
483 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 
465 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 
476 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
489 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.56 
 
 
488 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
500 aa  87  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
491 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
483 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
488 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.52 
 
 
422 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
547 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0676  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  28 
 
 
479 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.84 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2076  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  24.84 
 
 
470 aa  57  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5329  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  28.42 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 
418 aa  53.9  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 
496 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 
490 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
486 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 
500 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.22 
 
 
490 aa  50.1  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5253  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.58 
 
 
486 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  24.19 
 
 
360 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
483 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
512 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 
498 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  23.67 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 
489 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 
512 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.14 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  20.63 
 
 
493 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 
474 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4786  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.07 
 
 
486 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 
471 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
490 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
483 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 
546 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2088  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  22.79 
 
 
479 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.25 
 
 
493 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>