66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2459 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 490 aa  986    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  26.63 
 
 		 518 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  25.25 
 
 		 488 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.35 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 493 aa  93.2  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.07 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  23.41 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.82 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  25.12 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 434 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 489 aa  54.3  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 492 aa  53.9  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  22.07 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  21.76 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  21.07 
 
 		 493 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 546 aa  47  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.93 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  20.5 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  20.52 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  24.71 
 
 		 506 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 514 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>