40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1476 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 478 aa  936    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 		 472 aa  279  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  38.34 
 
 		 471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  36.45 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  30.45 
 
 		 468 aa  246  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  29.88 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  27.52 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  25.77 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  22.54 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 471 aa  50.8  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 506 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 418 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  24.7 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  23 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0307  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  19.81 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.82 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>