133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3876 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
427 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 
434 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  27.32 
 
 
439 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 
423 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
482 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
435 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 
444 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  25.61 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  22.61 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  29.48 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 
512 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  29.91 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  32.62 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
506 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
477 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05840  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.36 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.597063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 
505 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 
471 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 
511 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  30.54 
 
 
499 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 
477 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
440 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 
444 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 
504 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
583 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 
449 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
547 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
488 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 
492 aa  60.1  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
440 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 
449 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 
475 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
478 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 
477 aa  57  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 
488 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  21.75 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  27.43 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 
490 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2777  O-antigen transporter  22.75 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.273029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
439 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.28 
 
 
495 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
494 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
478 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
419 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 
461 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 
509 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  23.73 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 
489 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
504 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 
418 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 
418 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 
486 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1305  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.899512  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.79 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 
526 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
483 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  29.35 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  29.38 
 
 
517 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.35 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  19.93 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
448 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
435 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 
430 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 
483 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 
479 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  27.23 
 
 
488 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
471 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
493 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  30.38 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  30.38 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  30.38 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>