50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3259 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 418 aa  827    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.84 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 488 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  24.05 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.49 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  20 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  22.92 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 471 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.2 
 
 		 518 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 487 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 483 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.83 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 475 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 444 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  22.94 
 
 		 485 aa  46.6  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  24.12 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  22.01 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>