61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0722 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  26.32 
 
 
464 aa  109  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
488 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
490 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
474 aa  93.2  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  24.81 
 
 
464 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
471 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  22.87 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
504 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  25 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
478 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  19.31 
 
 
518 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.15 
 
 
488 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
504 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
500 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 
468 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
538 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  30.34 
 
 
461 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
507 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  24.92 
 
 
493 aa  60.1  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
496 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 
472 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
496 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 
489 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  27.56 
 
 
469 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  19.45 
 
 
482 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
514 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1777  hypothetical protein  26.35 
 
 
399 aa  48.5  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00741649  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  22.93 
 
 
493 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  21.65 
 
 
506 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  20.41 
 
 
418 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 
511 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 
411 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
483 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 
500 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
487 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 
477 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>