41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0202 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 538 aa  1040    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  35.86 
 
 		 474 aa  280  6e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  35.85 
 
 		 511 aa  258  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  33.68 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  35.42 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 501 aa  253  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  36.67 
 
 		 497 aa  249  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  35.53 
 
 		 507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  36.44 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  30.86 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.58 
 
 		 493 aa  197  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  32.03 
 
 		 496 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  29.18 
 
 		 464 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 499 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  24.75 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.41 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 496 aa  87.8  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  20.67 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  19.73 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  16.95 
 
 		 488 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 449 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 490 aa  50.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 493 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  18.87 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 500 aa  47.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 482 aa  47  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  19.07 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2235  hypothetical protein  28.94 
 
 		 535 aa  43.5  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.784831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>