38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1745 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  70.26 
 
 
504 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
507 aa  999    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  69.31 
 
 
504 aa  670    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  71.68 
 
 
504 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  68.76 
 
 
511 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  62.25 
 
 
501 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  61.17 
 
 
497 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  36.47 
 
 
474 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 
538 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  29.85 
 
 
493 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 
496 aa  157  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  29.24 
 
 
472 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
499 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
500 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  25.85 
 
 
506 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 
511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  26.67 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 
464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.67 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.85 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  26.6 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
483 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  20.32 
 
 
488 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
483 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
483 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 
491 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
418 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
481 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 
479 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>