42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0469 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 511 aa  1008    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  66.87 
 
 		 504 aa  636    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  74.23 
 
 		 504 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  64.91 
 
 		 507 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  63.4 
 
 		 504 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  62.8 
 
 		 501 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  66.89 
 
 		 497 aa  588  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  35.97 
 
 		 538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  35.01 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  31 
 
 		 493 aa  180  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  28.43 
 
 		 506 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 496 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  27.77 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 511 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 500 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  23.23 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  25.66 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  24.14 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.3 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.86 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  19.21 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 479 aa  53.9  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 490 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.49 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 481 aa  47  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 422 aa  43.9  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 430 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>