56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0577 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 500 aa  943    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  30.53 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  19.63 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  21.05 
 
 		 485 aa  67  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  31.37 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  27.88 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25.06 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  32.09 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  29.72 
 
 		 494 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  30.1 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  23.51 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 489 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  55.32 
 
 		 482 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  28.64 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  29.29 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  27.32 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 488 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 422 aa  43.5  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>