105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0172 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  100 
 
 
495 aa  943    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  59.87 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  52.36 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  47.34 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  47.07 
 
 
492 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  42.51 
 
 
494 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  43.79 
 
 
516 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 
489 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
499 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  28.54 
 
 
447 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.06 
 
 
517 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 
495 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
539 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
430 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  25.25 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
453 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  31.82 
 
 
446 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  33.98 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  32.37 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  24.07 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  30.66 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
529 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  29.27 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.17 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 
453 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
486 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
458 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
489 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  31.75 
 
 
474 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  37.36 
 
 
445 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
407 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.65 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 
468 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 
500 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  30.9 
 
 
458 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
441 aa  60.5  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  36.67 
 
 
582 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
506 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  32.87 
 
 
431 aa  56.6  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  30.96 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
505 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
429 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 
477 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 
444 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 
446 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 
475 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
496 aa  53.9  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 
482 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  31.61 
 
 
442 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
489 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 
486 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  25.13 
 
 
484 aa  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  35.5 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.53 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  25.13 
 
 
523 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  19.34 
 
 
482 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  31.13 
 
 
458 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  31.45 
 
 
135 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  25 
 
 
450 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 
485 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
547 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
546 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  23.58 
 
 
499 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 
488 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  30.71 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.83 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
477 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  32.03 
 
 
536 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
507 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  20.5 
 
 
476 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>