37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1836 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  81.63 
 
 		 522 aa  682    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  962    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.4 
 
 		 495 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  36.89 
 
 		 536 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  37.89 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.65 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  35.22 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  31.95 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.82 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  34.11 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  34.11 
 
 		 471 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  28.29 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  26.28 
 
 		 496 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  21.59 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  28.39 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  40.3 
 
 		 474 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 407 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>