39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1827 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  970    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  80.58 
 
 		 523 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.72 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  37.53 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  37.57 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  35.26 
 
 		 582 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.56 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  31.36 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  27.41 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  28.28 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  22.91 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  32.87 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  33.58 
 
 		 471 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 495 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  28.25 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  28.65 
 
 		 496 aa  51.2  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 468 aa  50.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 460 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 475 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  42.25 
 
 		 474 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 		 407 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 456 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>