66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8594 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
434 aa  824    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  44.5 
 
 
495 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  41.76 
 
 
536 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  32.15 
 
 
522 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  43.78 
 
 
582 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 
495 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
539 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.12 
 
 
517 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
494 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
459 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 
453 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  28.88 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  34.21 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 
490 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  33.71 
 
 
458 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
461 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  16.84 
 
 
499 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
135 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
458 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  26.97 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
498 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  21.59 
 
 
508 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  27.62 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 
489 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
516 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 
474 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  23.04 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
456 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
489 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 
526 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 
445 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
484 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
504 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
407 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 
444 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  19.05 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  20.71 
 
 
484 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 
512 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2946  hypothetical protein  29.31 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  22.06 
 
 
544 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  33.33 
 
 
523 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 
456 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  25.87 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  26.21 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
458 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  33.59 
 
 
503 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 
455 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 
483 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
899 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 
424 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 
441 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>