134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2438 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 495 aa  969    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  56.52 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  47.25 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  52.67 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  46.71 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  43.93 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  43.21 
 
 		 492 aa  342  7e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.77 
 
 		 517 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 489 aa  94.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 539 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  24.26 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  29.64 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  23.57 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.19 
 
 		 495 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  22.98 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  29.3 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 484 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  22.1 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 582 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  29.25 
 
 		 529 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.16 
 
 		 490 aa  54.3  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  21.57 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.98 
 
 		 458 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 135 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  21.66 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  21.35 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  19.36 
 
 		 486 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  25.31 
 
 		 513 aa  50.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 449 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  21.25 
 
 		 519 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 535 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  25.99 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  21.44 
 
 		 519 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  21.25 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  21.25 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  22.44 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  24.89 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  21.25 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  21.25 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  21.25 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  19.64 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  21.25 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  21.25 
 
 		 519 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 481 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  19.08 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2908  polysaccharide biosynthesis protein  37.14 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000392741  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>