19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1074 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 476 aa  912    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  25.96 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  19.48 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 1103 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 1103 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  20.69 
 
 		 494 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  22.61 
 
 		 495 aa  43.1  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>