102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2073 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 492 aa  959    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  49.39 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  47.45 
 
 		 496 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  47.55 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  43.21 
 
 		 495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  47.07 
 
 		 495 aa  331  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  39.96 
 
 		 516 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 489 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 539 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  30.69 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.46 
 
 		 517 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  29.25 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  31.52 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  30.05 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  21.67 
 
 		 435 aa  67  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  24.41 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 505 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 486 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  32.57 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  22.71 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.32 
 
 		 490 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  23.84 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 490 aa  53.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.62 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  23.56 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 444 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.98 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 		 429 aa  50.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 434 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 		 582 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  25.76 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 458 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  30.8 
 
 		 536 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 486 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  29.91 
 
 		 135 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  26.32 
 
 		 523 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>